Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r25W4VSP2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms