Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2afb2S4R1M3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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