Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt27Q9Z320 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms