Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Mbd3Q9Z2D8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mbd3Q9Z2D8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms