Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd4Q9Z2D7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd4Q9Z2D7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms