Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdpk1Q9Z2A0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms