Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnapinQ9Z266 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms