Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn8Q9Z260 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms