Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Thbs4Q9Z1T2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Thbs4Q9Z1T2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms