Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sh3bp5Q9Z131 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bp5Q9Z131 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms