Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hmg20bQ9Z104 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hmg20bQ9Z104 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hmg20bQ9Z104 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hmg20bQ9Z104 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmg20bQ9Z104 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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