Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx1Q9WV80 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx1Q9WV80 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms