Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnfsf13bQ9WU72 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfsf13bQ9WU72 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 403.8 ms