Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pfdn5Q9WU28 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pfdn5Q9WU28 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pfdn5Q9WU28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pfdn5Q9WU28 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pfdn5Q9WU28 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn5Q9WU28 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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