Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptpn4Q9WU22 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptpn4Q9WU22 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms