Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh13Q9WTR5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms