Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trpc2Q9R244 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms