Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Wdr54Q9R0D8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Wdr54Q9R0D8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms