Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AmfrQ9R049 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AmfrQ9R049 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms