Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d3cQ9QZS8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms