Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnf4Q9QZS2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf4Q9QZS2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms