Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2afyQ9QZQ8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2afyQ9QZQ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms