Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChmlQ9QZD5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms