Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms