Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnt3Q9QZ47 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tnnt3Q9QZ47 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms