Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmeff2Q9QYM9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmeff2Q9QYM9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms