Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx4Q9QY61 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms