Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Foxe3Q9QY14 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Foxe3Q9QY14 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Foxe3Q9QY14 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Foxe3Q9QY14 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms