Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms