Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad18Q9QXK2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad18Q9QXK2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms