Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdcQ9QW08 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms