Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid2Q9QUS6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mid2Q9QUS6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms