Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arl6ip4Q9JM93 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arl6ip4Q9JM93 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms