Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc4apQ9JLV2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trpc4apQ9JLV2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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