Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Col5a3Q9JLI2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Col5a3Q9JLI2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Col5a3Q9JLI2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Col5a3Q9JLI2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col5a3Q9JLI2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms