Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr5Q9JLF7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms