Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnot9Q9JKY0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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