Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chrac1Q9JKP8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms