Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Tmod2Q9JKK7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmod2Q9JKK7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms