Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms