Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp5Q9JKD3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scamp5Q9JKD3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms