Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3m1Q9JKC8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms