Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddx20Q9JJY4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms