Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sv2aQ9JIS5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sv2aQ9JIS5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms