Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MkksQ9JI70 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms