Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LratQ9JI60 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LratQ9JI60 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms