Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClpxQ9JHS4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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