Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim2Q9ESN6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms