Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OtofQ9ESF1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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