Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Usp29Q9ES63 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp29Q9ES63 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp29Q9ES63 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms